Die Flachrücken-Schildkröte wird von der IUCN als „Datenmangel“ eingestuft, was bedeutet, dass nicht genug Informationen vorliegen, um ihren Populationsstatus zu bestimmen. Sie ist Bedrohungen wie dem Verlust von Lebensräumen, menschlichen Störungen und dem Klimawandel ausgesetzt, der ihre Nistplätze beeinträchtigt.